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混合搜索策略相比于蛋白质序列搜索策略有哪些优势？如何利用木质素合理设计出使剧毒的4-硝基苯酚还原成4-氨基苯酚的高效催化剂？前额叶丘脑回路与人类认知中有哪些作用？

本期线上博士领航活动为大家邀请到了三位澳门大阳城集团2138网站的博士，将于2023年4月14日（周五）18:30通过线上文献领读（腾讯会议：230-508-513）的方式来给大家解答这几个问题。

当然，大家还能向在科研方面有资深经验的学长、学姐们咨询其他科研相关内容哦，机会难得，欢迎大家踊跃参加~

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孙晨

A Hybrid Spectral Library and Protein Sequence Database Search Strategy for Bottom-Up and Top-Down Proteomic Data Analysis

串联质谱法 (MS/MS) 被广泛用于分析复杂的蛋白质组样品，自上而下(Top-Down)和自下而上(Bottom-up)是两种基于质谱分析的蛋白质组学方法。蛋白质鉴定则是蛋白质分析的重要一环。虽现已经开发了多种搜索工具用于蛋白质组学分析，但这些搜索工具都各有千秋。基于蛋白质序列数据库的搜索方法和基于谱库的搜索方法为最为主流的两种肽鉴定方法。然而，蛋白质序列数据库存在谱图缺乏峰强度信息、基于序列生成的理论质谱图准确率低等问题。谱库搜索含有真实的峰强度信息和非典型的碎片离子信息，从一定程度上弥补了序列搜索的不足；但谱库搜索的短板在于其肽鉴定仅限于分析库中所包含谱的肽段。且谱库搜索目前也仅用于Bottom-up方法，而未用于Top-down方法中。

本次分享的是威斯康星大学于2022年发表的一篇文章。通过结合蛋白质序列数据库和谱库搜索的混合搜索策略来解决上述所说的局限，以提高蛋白质鉴定的成功率和灵敏度。文章提出的混合搜索策略包含三个步骤：首先，通过序列搜索的方式进行初步的肽鉴定；再将初步鉴定的谱图送入谱库搜索中与谱库中的质谱图进行比较，计算相似性。最后，通过二元决策树来决定最后的肽谱匹配结果并计算肽谱匹配的后验误差概率。该文章是第一个将序列搜索和谱库搜索结合起来的蛋白质鉴定策略，该搜索策略可用于Bottom-up和Top-Down方法中。相比起蛋白质序列搜索策略，混合搜索策略从一定程度上提高了蛋白质鉴定中肽谱匹配鉴定的成功率。

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肖文哲

Fully exposed silver nanoparticles stabilized on pH-responsive lignin-reactors for enhanced 4-nitrophenol reduction

剧毒的4-硝基苯酚（4-NP）一直被认为是“优先污染物”，而作为其还原产物的4-氨基苯酚（4-AP）却在制药等行业中表现出巨大的应用价值。4-NP的催化通常需以硼氢化钠（NaBH4）作为还原剂，还原电势（4-NP/4-AP，-0.76 V；H3BO3/BH4-，-1.33 V）证明该反应在热力学上可行；但由于动力学障碍使4-NP还原反应必须要有催化剂加入才可进行。因此，调控金属活性位点周围的化学微环境以增强金属与载体间相互作用对合理设计高效催化剂具有十分重要的指导意义。

木质素因其丰富的官能团、天然的交联网络结构以及良好的生物降解性而备受关注。本研究采用自组装方法，将银纳米颗粒（Ag NPs）包埋在预水解木质素内部或负载于木质素外部（分别命名为Ag/PL或Ag@PL），制备了一对木质素反应器，可用于高效催化还原4-NP。通过该策略，可以根据木质素的pH响应性来实现反应器的相变和形态变化。结果表明，Ag/PL表现出的催化活性（TOF，5.2 × 103 h−1；k，4.8 × 10−2 s−1）比Ag@PL（TOF，2.5 × 103 h−1；k，2.3 × 10−2 s−1）更高，且明显优于先前报道的碳基催化剂。Ag/PL催化性能的提高是由于完全暴露在界面上的Ag NPs与反应物的距离较近。这项工作不仅为设计先进的废水处理催化剂提供了一条可行的途径，而且为木质素稳定化制备功能材料铺平了道路。

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王可欣

The human mediodorsal thalamus: Organization, connectivity, and function

丘脑背侧核 (MD) 是一种高阶中继核，参与调节皮层网络，并是与许多神经和精神疾病相关的关键结构，因此MD被认为是深部脑刺激 (DBS) 治疗顽固性精神分裂症的潜在靶点。解剖学证据表明，MD 通过与前额叶皮层的广泛联系在注意力、计划、抽象思维、情感和工作记忆等多种认知功能中发挥着至关重要的作用。然而，MD的详细结构组织以及阐明其子区域与人类行为之间的关系仍然知之甚少。

 在这项研究中，使用 Human Connectome Project 提供的高分辨率数据，采用基于解剖连接的方法来揭示 MD 的地形组织。在每个半球中确定了四个细粒度的子区域，包括内侧 (MDm)、中央 (MDc)、背侧 (MDd) 和外侧 (MDl)，它们从组织学研究中概括了先前的细胞构造边界。随后对子区域的连通性分析也证明了不同的解剖学和功能连通性模式，尤其是前额叶皮层。为了进一步评估 MD 子区域的功能，进行了偏最小二乘法分析以检查 1012 名受试者的不同前额叶子区域连通性和行为测量之间的关系。结果显示特定于次区域的参与一系列认知功能。具体而言，MDm 主要支持情绪认知领域，而 MDl 参与多种认知功能，尤其是认知灵活性和抑制。MDc 和 MDd 与流体智力、处理速度和情绪认知相关。总之，此项工作为 MD 的解剖学和功能组织提供了新的见解，并强调了前额叶丘脑回路在人类认知中的各种作用。

重点！

时间：2023年4月14日（周五）18:30

地点：腾讯会议：230-508-513